经常做细胞实验的你,想必一定遇到过这个难题:细胞收集,究竟哪种方案最合适?
离心收集or瓶内裂解or胰酶消化?今天,跟着小岳一起来了解一下细胞收集方法的优劣对比及操作步骤!
1、离心法
优点:离心法操作方便,同时我们可根据收集到的细胞沉淀来加入适量的裂解液,从而能够控制样品蛋白的浓度。
缺点:在离心过程中却容易造成细胞破碎而降低总蛋白得率,同时会造成细胞外基质(ECM)的丢失,从而造成样品蛋白质图谱的不完整。
(注:细胞外基质(ECM)是由细胞外大分子和矿物质(如胶原蛋白、酶、糖蛋白和羟基磷灰石)组成的三维网络,为周围细胞提供结构和生化支持。因为多细胞在不同的多细胞谱系中独立进化,细胞外基质的组成因多细胞结构而异;然而,细胞粘附、细胞间通讯和分化是ECM的常见功能。细胞外基质主要由5类物质组成,即胶原蛋白、非胶原蛋白、弹性蛋白、蛋白聚糖与氨基聚糖,按分布部位划分主要分为基底膜(Basement membrane)和间质基质(Interstitial matrix))
2、瓶内裂解法
优点:瓶内裂解法最大的优点是可以有效的防止细胞在离心过程中破碎,能有效的提高总蛋白得率,同时也能完整的保留细胞外基质(ECM)。
缺点:操作会相对复杂,且不易控制加入的裂解液量,往往会造成总蛋白浓度低且粘度高等情况;对于一些药物处理的细胞和贴壁不牢的细胞,使用此方法在清洗阶段也容易造成细胞大量丢失。
3、胰酶消化法
优点:胰酶处理的细胞个体形态单一,不聚团,对细胞损伤小。
缺点:会造成细胞外基质(ECM)的完全丢失,同时会剪切一些对胰酶敏感的蛋白。
对于WB蛋白样品中是否含有对胰酶敏感的蛋白,我们往往不太确定,同时胰蛋白酶也属于外来蛋白质,如果不能做到彻底清除,同样会污染我们的样本。所以用于WB的细胞样品不建议使用胰酶消化法收集细胞。
每一种方法都有自己的优势和局限性,我们要根据自己的细胞类型选择合适的细胞收集方式。
离心法:适用于悬浮细胞、贴壁不牢和药物处理过的细胞;
瓶内裂解法:适用于所有的贴壁细胞;
胰酶消化法:适用于目的蛋白非细胞外基质(ECM)或对胰酶不敏感的蛋白。
在一般情况下,根据经验会首推瓶内裂解法,其次离心法;不推荐胰酶消化法。